Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SmsP97355 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SmsP97355 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms