Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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NfixP70257 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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NfixP70257 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfixP70257 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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NfixP70257 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfixP70257 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfixP70257 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms