Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Hoxd13P70217 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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