Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms