Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms