Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms