Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b6P59708 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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