Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp25P57080 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp25P57080 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms