Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CnbpP53996 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms