Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms