Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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