Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VdrP48281 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VdrP48281 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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