Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms