Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdkn1bP46414 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms