Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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