Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc1P29341 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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