Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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