Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms