Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms