Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TP20293 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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