Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox5bP19536 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox5bP19536 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms