Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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