Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06344 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06344 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06344 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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