Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms