Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pkd2O35245 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Pkd2O35245 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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