Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms