Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3371F7CQW8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3371F7CQW8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3371F7CQW8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3371F7CQW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3371F7CQW8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3371F7CQW8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms