Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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