Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms