Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms