Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms