Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm3543D3Z235 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm3543D3Z235 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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