Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmf1B9EKI3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmf1B9EKI3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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