Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Phf11bB4XVQ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Phf11bB4XVQ1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms