Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Phf11cB4XVP9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Phf11cB4XVP9 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Phf11cB4XVP9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Phf11cB4XVP9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Phf11cB4XVP9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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