Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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