Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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