Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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