Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ckap5A2AGT5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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