Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms