Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms