Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms