Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn9Q9Z0S7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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