Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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