Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mid2Q9QUS6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms