Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SrfQ9JM73 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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