Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hmgn5Q9JL35 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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