Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pole3Q9JKP7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pole3Q9JKP7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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