Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc46a3Q9DC26 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms