Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms